Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 SLFN13-204ENST00000526861 6004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 EIF3EP2-201ENST00000423042 1814 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 CLTC-215ENST00000621829 8587 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 CLASP1-215ENST00000541377 7909 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 RYR2-202ENST00000366574 16562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 NAV1-202ENST00000367296 13091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 MALAT1-202ENST00000534336 8708 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 MAVS-201ENST00000416600 11596 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 DTNA-225ENST00000595022 6016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 OR2T12-202ENST00000641276 5708 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
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HERC1Q15751 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 KIF1B-212ENST00000622724 8588 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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HERC1Q15751 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
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HERC1Q15751 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AL034408.1-201ENST00000637712 664 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 SPTB-208ENST00000556626 10153 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 GAS7-204ENST00000437099 8003 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 LNPEP-201ENST00000231368 12752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AL161756.1-201ENST00000555861 1751 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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