Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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SS18Q15532 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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