Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms