Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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HOXA13P31271 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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HOXA13P31271 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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HOXA13P31271 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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HOXA13P31271 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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HOXA13P31271 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXA13P31271 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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