Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD10P28358 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
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HOXD10P28358 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
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HOXD10P28358 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
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HOXD10P28358 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
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