Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 ADGRL3-205ENST00000506746 4935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 ZNF573-202ENST00000357309 2124 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLR2AP24928 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms