Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AL079307.1-201ENST00000553312 5982 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 TENM4-201ENST00000278550 14000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 SLC23A2-202ENST00000379333 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 CFAP54-202ENST00000524981 9766 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AL034408.1-201ENST00000637712 664 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 CPEB4-201ENST00000265085 9483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 CA5A-201ENST00000309893 7567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 MUC3A-203ENST00000483366 9944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AL512634.1-201ENST00000566873 2432 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 UNC79-206ENST00000621021 7377 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 TP53BP1-203ENST00000382044 10384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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