Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 PBLD-204ENST00000358769 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC002486.2-201ENST00000447806 590 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms