Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC96Q2M329 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC96Q2M329 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC96Q2M329 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC96Q2M329 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC96Q2M329 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC96Q2M329 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC96Q2M329 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC96Q2M329 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC96Q2M329 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC96Q2M329 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC96Q2M329 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC96Q2M329 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC96Q2M329 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC96Q2M329 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms