Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms