Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms