Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
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TCIRG1Q13488 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
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TCIRG1Q13488 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
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