Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TCOF1Q13428 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms