Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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ITGB3BPQ13352 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
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ITGB3BPQ13352 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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ITGB3BPQ13352 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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ITGB3BPQ13352 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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ITGB3BPQ13352 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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ITGB3BPQ13352 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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ITGB3BPQ13352 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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ITGB3BPQ13352 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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ITGB3BPQ13352 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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