Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SGCGQ13326 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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