Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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CHAF1BQ13112 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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CHAF1BQ13112 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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CHAF1BQ13112 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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CHAF1BQ13112 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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CHAF1BQ13112 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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CHAF1BQ13112 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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