Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 JAML-213ENST00000640745 951 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 EPB41L1-201ENST00000202028 3514 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 A2ML1-205ENST00000539547 3460 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
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MKRN3Q13064 AL391666.1-201ENST00000442570 2764 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 TNS4-201ENST00000254051 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 KLF7-202ENST00000412414 7954 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 BMX-201ENST00000342014 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 PTPN3-201ENST00000262539 6832 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 TEP1-201ENST00000262715 10695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 TFDP2-212ENST00000486111 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
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MKRN3Q13064 CNTNAP2-203ENST00000463592 6076 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 RND3-202ENST00000375734 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 B3GALT5-202ENST00000380618 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
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MKRN3Q13064 HEATR4-201ENST00000334988 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 TMED8-201ENST00000216468 7784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
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MKRN3Q13064 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
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MKRN3Q13064 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
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MKRN3Q13064 CNR1-202ENST00000369499 5549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 TMCC3-203ENST00000551457 4361 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
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MKRN3Q13064 AL357556.1-201ENST00000421884 1388 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 PDE4DIP-203ENST00000369349 4677 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 RRN3-203ENST00000429751 2198 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 NLRP3-206ENST00000391828 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
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MKRN3Q13064 LINC01748-202ENST00000634281 2864 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 KIF1B-201ENST00000263934 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 RN7SKP208-201ENST00000365474 361 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
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