Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IRX1P78414 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
IRX1P78414 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IRX1P78414 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
IRX1P78414 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
IRX1P78414 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IRX1P78414 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
IRX1P78414 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
IRX1P78414 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IRX1P78414 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IRX1P78414 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
IRX1P78414 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
IRX1P78414 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
IRX1P78414 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IRX1P78414 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IRX1P78414 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
IRX1P78414 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IRX1P78414 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IRX1P78414 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IRX1P78414 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
IRX1P78414 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IRX1P78414 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IRX1P78414 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IRX1P78414 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IRX1P78414 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IRX1P78414 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
IRX1P78414 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
IRX1P78414 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IRX1P78414 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
IRX1P78414 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IRX1P78414 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
IRX1P78414 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
IRX1P78414 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
IRX1P78414 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
IRX1P78414 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
IRX1P78414 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
IRX1P78414 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
IRX1P78414 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
IRX1P78414 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
IRX1P78414 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
IRX1P78414 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
IRX1P78414 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
IRX1P78414 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
IRX1P78414 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
IRX1P78414 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
IRX1P78414 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
IRX1P78414 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
IRX1P78414 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
IRX1P78414 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
IRX1P78414 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
IRX1P78414 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
IRX1P78414 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
IRX1P78414 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
IRX1P78414 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
IRX1P78414 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
IRX1P78414 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms