Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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