Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
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PTPRBP23467 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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PTPRBP23467 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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PTPRBP23467 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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PTPRBP23467 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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PTPRBP23467 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
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