Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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