Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 DEFA11P-201ENST00000446470 261 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC090458.1-203ENST00000527757 546 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 TSC1-203ENST00000440111 8463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 SLC7A14-201ENST00000231706 10103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 MRAP-202ENST00000339944 440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms