Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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ZNF548Q8NEK5 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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ZNF548Q8NEK5 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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ZNF548Q8NEK5 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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