Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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