Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 KCNMA1-203ENST00000354353 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 ST18-201ENST00000276480 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 ENAH-204ENST00000366844 13168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 DIS3-201ENST00000377767 10604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 SPHKAP-202ENST00000392056 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 NFIB-218ENST00000636432 1953 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 GCNT3-201ENST00000396065 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AC024451.1-201ENST00000508013 779 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 CTNND1-201ENST00000358694 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 FANCM-201ENST00000267430 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 ZFX-204ENST00000379188 7513 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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