Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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