Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 LINC01762-205ENST00000437308 539 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms