Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC132219.2-201ENST00000624416 2327 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 PPP4R1-AS1-201ENST00000582435 379 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC007993.1-201ENST00000621298 2430 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 DMC1-203ENST00000428462 2082 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 ZNF667-208ENST00000629654 3265 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
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