Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
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SEC23BQ15437 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
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SEC23BQ15437 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
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SEC23BQ15437 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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SEC23BQ15437 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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SEC23BQ15437 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
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SEC23BQ15437 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
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