Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms