Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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RAB39AQ14964 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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RAB39AQ14964 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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RAB39AQ14964 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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RAB39AQ14964 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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RAB39AQ14964 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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