Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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