Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 CNTNAP2-203ENST00000463592 6076 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
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