Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 TSC22D1-213ENST00000622051 2872 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 ASCC1-201ENST00000317126 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 CFI-201ENST00000394634 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 PDZK1P1-201ENST00000401008 3498 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 CNN3P1-201ENST00000401596 935 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 RN7SKP254-201ENST00000410685 310 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 MYL6P3-201ENST00000436904 432 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AP005597.2-201ENST00000526238 341 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 UBE2CP1-201ENST00000557130 554 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AC090181.1-201ENST00000560446 264 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 MT1B-202ENST00000562399 351 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AC005837.2-201ENST00000587459 479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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HOXA2O43364 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 MET-204ENST00000436117 2295 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 UNC79-202ENST00000393151 7908 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 IFT88-201ENST00000319980 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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HOXA2O43364 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 VCAM1-204ENST00000370119 2483 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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HOXA2O43364 AC116535.1-201ENST00000499765 2335 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 TBC1D5-219ENST00000446818 3124 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 CD2-202ENST00000369478 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 KLHL2-202ENST00000421009 2452 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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HOXA2O43364 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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HOXA2O43364 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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HOXA2O43364 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AC117395.2-201ENST00000463122 1128 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 RPS26P11-201ENST00000463445 348 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 RPS26P6-201ENST00000475156 348 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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