Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms