Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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CHD4Q14839 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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CHD4Q14839 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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CHD4Q14839 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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CHD4Q14839 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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CHD4Q14839 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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