Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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DDX39BQ13838 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
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DDX39BQ13838 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
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DDX39BQ13838 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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