Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
PTCH1Q13635 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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PTCH1Q13635 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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PTCH1Q13635 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTCH1Q13635 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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