Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms