Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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CHAF1BQ13112 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
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