Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHAF1AQ13111 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
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