Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EPHB4P54760 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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