Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
C18orf8Q96DM3 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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