Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
AP5B1Q2VPB7 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms