Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms