Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SMCO1Q147U7 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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