Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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