Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AC140479.4-205ENST00000636339 820 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 OR7E161P-202ENST00000641994 1033 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 DIAPH3-201ENST00000267215 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 DIAPH3-204ENST00000400320 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AL353753.1-201ENST00000612217 2320 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 GON4L-219ENST00000622608 4801 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 MASP1-205ENST00000392472 3900 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 KALRN-202ENST00000291478 10888 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 MCM6-201ENST00000264156 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 POGZ-218ENST00000531094 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 ZEB2-232ENST00000636026 5172 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 CEP192-202ENST00000430049 3286 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 FBXO11-202ENST00000403359 4055 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 NAA11-201ENST00000286794 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 SUPT7L-205ENST00000464789 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 CHIC1-201ENST00000373502 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 MAPK10-290ENST00000641237 2826 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AL049646.1-201ENST00000457009 2490 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 ACSBG2-206ENST00000588485 2478 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 TTTY15-202ENST00000440408 5284 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 DDX10P2-201ENST00000417796 2614 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 ADGRE3-201ENST00000253673 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 SLC9A6-213ENST00000637234 4691 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 MACROD2-202ENST00000378058 4025 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 SAMD3-204ENST00000439090 2093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 NLRP3-202ENST00000348069 3828 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 RN7SKP208-201ENST00000365474 361 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 SRI-202ENST00000394641 653 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 EEF1GP7-201ENST00000422983 703 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 ZNF385D-AS2-202ENST00000448980 370 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AC009269.1-201ENST00000470368 833 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AC015820.1-201ENST00000473882 321 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 RN7SL332P-201ENST00000482163 254 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 PGAM4P2-201ENST00000512491 721 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 PSD2-AS1-201ENST00000515306 412 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 NUDT7-206ENST00000568787 678 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 ZNF561-AS1-208ENST00000592851 782 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AL096855.2-201ENST00000605785 369 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AC104184.1-201ENST00000607513 721 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 LINC01347-202ENST00000627498 3841 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 HELQ-204ENST00000510985 3315 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 IL16-204ENST00000394660 9616 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 PSG3-204ENST00000595140 1724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 THG1L-201ENST00000231198 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 USP37-204ENST00000418019 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 FAM13A-205ENST00000503556 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 TMEM43-201ENST00000306077 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AC026124.1-201ENST00000545709 3457 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 CFAP54-202ENST00000524981 9766 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 NOP14-AS1-207ENST00000515194 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 MTRR-201ENST00000264668 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 ZNF215-202ENST00000414517 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 ZFX-204ENST00000379188 7513 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 DAZ1-202ENST00000405239 4421 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 FGFR2-213ENST00000369061 3803 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms