Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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HOXD13P35453 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
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HOXD13P35453 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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HOXD13P35453 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
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HOXD13P35453 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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HOXD13P35453 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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HOXD13P35453 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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HOXD13P35453 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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HOXD13P35453 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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HOXD13P35453 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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