Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 ZNF876P-201ENST00000356347 2598 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 CELF2-201ENST00000354897 1754 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 PAQR5-202ENST00000395407 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 GAS2L3-205ENST00000547754 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 NDFIP2-206ENST00000620924 2324 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 CYFIP1-203ENST00000610365 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 NAV2-213ENST00000533917 5084 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 RHOH-201ENST00000381799 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 OGFOD1-207ENST00000566157 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 BTBD16-201ENST00000260723 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 RNASE9-207ENST00000555230 2668 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 SCGB1A1-201ENST00000278282 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 ARL17A-201ENST00000329240 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 TRBV7-5-201ENST00000390382 345 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AC026254.1-201ENST00000479473 431 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 EVX1-AS-201ENST00000517726 480 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AL158151.4-201ENST00000600965 507 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 OR6L2P-201ENST00000608207 925 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AC025287.3-201ENST00000611726 501 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AL121955.1-201ENST00000620852 303 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AC091953.1-201ENST00000624775 296 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 DDX24-201ENST00000330836 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 SLC12A3-203ENST00000563236 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 CNTNAP4-201ENST00000307431 4867 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 CNTNAP4-207ENST00000611870 4867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 ECD-203ENST00000430082 2246 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 ANKRD50-201ENST00000504087 8794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 MFSD9-201ENST00000258436 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 CARF-216ENST00000444724 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 STK36-207ENST00000440309 4721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 NETO2-201ENST00000303155 3241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 LAMA1-201ENST00000389658 9657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 CES5A-201ENST00000290567 2084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 CEP63-201ENST00000332047 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 GLDC-208ENST00000638661 1796 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 RBM23-204ENST00000399922 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 ERVW-1-202ENST00000603053 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 STRIP1-202ENST00000369796 3125 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 ZNF577-214ENST00000639636 3148 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AGAP1-207ENST00000428334 10090 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 KANK1-210ENST00000619269 5688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 MS4A10-201ENST00000308287 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 MBTPS2-202ENST00000379484 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 ARHGAP19-203ENST00000371027 2301 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 ZEB2-236ENST00000636471 9583 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AL049839.2-201ENST00000553947 3067 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 TMEM184C-201ENST00000296582 4178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
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HOXD11P31277 CLUHP5-201ENST00000438421 774 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AC019185.3-201ENST00000438805 323 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 MIR200CHG-201ENST00000537269 350 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
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HOXD11P31277 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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HOXD11P31277 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
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HOXD11P31277 PTPRK-205ENST00000368213 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 ODF2-219ENST00000546203 2140 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 ZNF549-202ENST00000376233 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 MAPK10-343ENST00000641677 2546 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 CEP41-219ENST00000616628 3315 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 PRRG1-209ENST00000543642 4509 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 PTGS1-202ENST00000362012 4964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 LINC01091-204ENST00000515769 2204 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 VIPR1-AS1-201ENST00000452639 1435 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 SORL1-212ENST00000534286 3501 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 Z82186.1-201ENST00000434707 4364 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 BMF-202ENST00000397573 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 KEL-201ENST00000355265 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 KCTD7-211ENST00000640851 3745 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 CD163L1-202ENST00000416109 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 SYNPO2-201ENST00000307142 7295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 ZNF695-201ENST00000339986 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 ABAT-202ENST00000396600 5586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 SEMA4D-207ENST00000420987 4275 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AGK-203ENST00000473247 1550 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 SMG7-215ENST00000515829 5629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 ACSL6-221ENST00000543479 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AC010680.2-201ENST00000603521 2117 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
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